Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tubg1P83887 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tubg1P83887 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms