Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Irx2P81066 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx2P81066 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx2P81066 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Irx2P81066 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx2P81066 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms