Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnb1P62874 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnb1P62874 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gnb1P62874 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gnb1P62874 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gnb1P62874 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gnb1P62874 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gnb1P62874 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gnb1P62874 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gnb1P62874 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms