Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snrpd2P62317 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpd2P62317 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms