Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2kP61087 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2kP61087 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms