Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Csrnp3P59055 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Csrnp3P59055 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms