Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P58686 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P58686 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P58686 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P58686 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P58686 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P58686 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P58686 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P58686 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P58686 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P58686 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P58686 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
P58686 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P58686 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms