Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Strn4P58404 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Strn4P58404 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Strn4P58404 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms