Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tnfsf10P50592 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfsf10P50592 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms