Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SftpdP50404 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SftpdP50404 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SftpdP50404 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms