Protein–RNA interactions for Protein: P47867

Scg3, Secretogranin-3, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg3P47867 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scg3P47867 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg3P47867 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms