Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa2P31245 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hoxa2P31245 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms