Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RxrgP28705 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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