Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gabra2P26048 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms