Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja1P23242 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja1P23242 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms