Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Bmp4P21275 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms