Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TP20293 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TP20293 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TP20293 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TP20293 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TP20293 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP20293 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP20293 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP20293 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP20293 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP20293 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP20293 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TP20293 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms