Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ntf3P20181 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms