Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ifrd1P19182 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ifrd1P19182 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms