Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sdc1P18828 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sdc1P18828 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sdc1P18828 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc1P18828 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc1P18828 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc1P18828 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sdc1P18828 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sdc1P18828 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sdc1P18828 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sdc1P18828 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Sdc1P18828 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms