Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb1P17919 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxb1P17919 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 293.1 ms