Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTAP09496 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTAP09496 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTAP09496 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTAP09496 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTAP09496 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLTAP09496 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLTAP09496 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTAP09496 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTAP09496 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTAP09496 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTAP09496 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTAP09496 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTAP09496 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLTAP09496 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLTAP09496 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLTAP09496 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms