Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LtaP09225 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LtaP09225 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LtaP09225 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LtaP09225 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
LtaP09225 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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