Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06320 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06320 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P06320 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06320 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P06320 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P06320 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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