Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CcnkO88874 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcnkO88874 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CcnkO88874 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms