Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm10509O88255 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Gm10509O88255 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm10509O88255 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Gm10509O88255 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm10509O88255 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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