Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sema6bO54951 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sema6bO54951 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Sema6bO54951 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms