Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NlkO54949 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NlkO54949 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NlkO54949 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NlkO54949 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NlkO54949 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NlkO54949 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NlkO54949 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NlkO54949 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NlkO54949 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NlkO54949 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NlkO54949 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms