Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Brs3O54798 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Brs3O54798 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Brs3O54798 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brs3O54798 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brs3O54798 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brs3O54798 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brs3O54798 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brs3O54798 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brs3O54798 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brs3O54798 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brs3O54798 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brs3O54798 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Brs3O54798 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms