Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ccl25O35903 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Ccl25O35903 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ccl25O35903 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Ccl25O35903 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccl25O35903 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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