Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Opn1mwO35599 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Opn1mwO35599 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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