Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf5O35445 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf5O35445 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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Rnf5O35445 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf5O35445 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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Rnf5O35445 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf5O35445 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rnf5O35445 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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