Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Dgcr6O35347 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms