Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc18a3O35304 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms