Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Casq1O09165 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Casq1O09165 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Casq1O09165 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Casq1O09165 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms