Protein–RNA interactions for Protein: O08786

Cckar, Cholecystokinin receptor type A, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckarO08786 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CckarO08786 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CckarO08786 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CckarO08786 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CckarO08786 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CckarO08786 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CckarO08786 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CckarO08786 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CckarO08786 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CckarO08786 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms