Protein–RNA interactions for Protein: L7N229

Gm4778, Predicted gene 4778, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4778L7N229 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm4778L7N229 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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