Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20877J3QPZ4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm20877J3QPZ4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Gm20877J3QPZ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Gm20877J3QPZ4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Gm20877J3QPZ4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gm20877J3QPZ4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms