Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nccrp1G3X9C2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nccrp1G3X9C2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms