Protein–RNA interactions for Protein: G3UW31

Vmn1r176, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r176G3UW31 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r176G3UW31 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r176G3UW31 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms