Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
5830473C10RikF8VQ07 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
5830473C10RikF8VQ07 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms