Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H2-M1F7CXU4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms