Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrp3E9Q1T6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrp3E9Q1T6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrp3E9Q1T6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Lrp3E9Q1T6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrp3E9Q1T6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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