Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc175E9PVB3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms