Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ifit3bE9PV48 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ifit3bE9PV48 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms