Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms