Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms