Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smok3bC0HKC9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smok3bC0HKC9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms