Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
AU015836B2RUM3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AU015836B2RUM3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms