Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apba1B2RUJ5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apba1B2RUJ5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms